A actividade da FNAP centra-se nos seguintes vectores de actividades:
- Promoção e defesa da apicultura nacional, junto de todos os interlocutores nacionais e inter nacionais com responsabilidades no sector;
- Promoção dos produtos da apicultura nacional: Mel, Pólen, Propolis, Cera, Veneno, Geleia Real, etc.;
- Realização de eventos, nomeadamente Congressos, Fóruns, Colóquios, Jornadas Técnicas e Reuniões, com o objectivo de debater a apicultura portuguesa, e todas as questões que a afectam;
- Acompanhamento e discussão das ferramentas de Política Agrícola que estão disponíveis para o sector apícola, tendo por objectivo tornar essas medidas mais eficazes e adaptadas à realidade do sector em Portugal;
- Colaboração e participação em estudos de cariz científico, com o objectivo de reforçar a competitividade do sector apícola português;
- Edição de publicações técnicas destinadas a informar os apicultores.